深圳地铁6号线各站点的运营时刻表，包括松岗站到 科学馆站，共计27个站点的时刻信息，含首末车时间，该时间表为常规运营时间表，不包含节假日差异化运营时间（周五、周六日以及节假日延长的运营时间），仅供参考！
| 开往 松岗 方向 | 开往 科学馆 方向 | |||
| 车站 | 首班车 | 末班车 | 首班车 | 末班车 |
| 松岗 | - | - | 06:22 | 23:00 |
| 溪头 | 06:34 | 00:09 | 06:24 | 23:01 |
| 松岗公园 | 06:31 | 00:06 | 06:26 | 23:03 |
| 薯田埔 | 06:29 | 00:04 | 06:29 | 23:06 |
| 合水口 | 06:26 | 00:01 | 06:31 | 23:09 |
| 公明广场 | 06:24 | 23:59 | 06:34 | 23:11 |
| 红花山 | 06:21 | 23:56 | 06:36 | 23:14 |
| 楼村 | 06:19 | 23:54 | 06:39 | 23:16 |
| 科学公园 | 06:16 | 23:51 | 06:41 | 23:18 |
| 光明 | 06:14 | 23:49 | 06:43 | 23:21 |
| 光明大街 | 06:12 | 23:47 | 06:46 | 23:23 |
| 凤凰城 | 06:09 | 23:44 | 06:48 | 23:26 |
| 长圳 | 07:01 | 23:41 | 06:06 | 23:29 |
| 上屋 | 06:56 | 23:36 | 06:03 | 23:34 |
| 官田 | 06:53 | 23:33 | 06:06 | 23:36 |
| 阳台山东 | 06:49 | 23:29 | 06:03 | 23:41 |
| 元芬 | 06:46 | 23:26 | 06:06 | 23:44 |
| 上芬 | 06:43 | 23:23 | 06:01 | 23:46 |
| 红山 | 06:40 | 23:20 | 06:04 | 23:50 |
| 深圳北站 | 06:38 | 23:18 | 06:13 | 23:47 |
| 梅林关 | 06:34 | 23:14 | 06:10 | 23:56 |
| 翰岭 | 06:30 | 23:10 | 06:14 | 23:59 |
| 银湖 | 06:27 | 23:07 | 06:17 | 00:02 |
| 八卦岭 | 06:25 | 23:05 | 06:19 | 00:04 |
| 体育中心 | 06:23 | 23:03 | 06:21 | 00:06 |
| 通新岭 | 06:22 | 23:02 | 06:23 | 00:08 |
| 科学馆 | 06:20 | 23:00 | - | - |
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